Wissenschaftler*in, Bioinformatiker*in, Data Scientist - Forschung Mikrobiom und Metagenomanalytik (w/m/d)

Universitätsklinikum Medizinische Fakultät Mannheim der Universität Heidelberg
Mannheim

Das Universitätsklinikum Heidelberg (UKHD) ist eines der bedeutendsten medizinischen Zentren in Deutschland und steht für die Entwicklung innovativer Diagnostik und Therapien sowie ihre rasche Umsetzung für den Patienten. Mit rund 14.000 Mitarbeitenden konzernweit in mehr als 50 klinischen Fachabteilungen mit über 2.500 Betten werden jährlich circa 80.000 Patienten voll- und teilstationär und mehr als 1.000.000 Mal Patienten ambulant behandelt.

Wissenschaftler*in, Bioinformatiker*in, Data Scientist - Forschung Mikrobiom und Metagenomanalytik (w/m/d)

zum nächstmöglichen Zeitpunkt am Zentrum für Infektiologie für das Abteilung Digitale und Molekulare Mikrobiologie (Ärztlicher Direktor: Prof. Dr. med. Ingo Autenrieth) gesucht.

Die Abteilung für Digitale und Molekulare Mikrobiologie am Zentrum für Infektiologie des UKHD untersucht und beforscht das Mikrobiom von Kranken und Gesunden mittels Metagenomik im Rahmen unterschiedlicher medizinischer und wissenschaftlicher Indikationen und Fragestellungen bei ambulanten und stationären Patienten sowie im Rahmen von klinischen Studien oder anderen Forschungsprojekten

  • Job-ID: V000015639
  • Einsatzgebiet: Digitale und Molekulare Mikrobiologie
  • Einsatzort: Heidelberg
  • Startdatum: ab sofort
  • Tätigkeitsbereich: Wissenschaft und Lehre
  • Anstellungsart: Vollzeit (100 %)
  • Vertrag: TV-L

Ihre Aufgaben

  • Etablierung und Anwendung computergestützter Methoden zur klinisch-mikrobiologischen Mikrobiom- und Metagenomanalytik im Rahmen der translationalen Forschung und Versorgung von Kranken und Gesunden Menschen
  • Etablierung und Anwendung bioinformatischer Verfahren inklusive Methoden zur Visualisierung der Mikrobiom- und Metagenomanalytik
  • Aufbau, Pflege und Weiterentwicklung reproduzierbarer Analyse-Pipelines für metagenomische und mikrobiombezogene Sequenzierdaten einschließlich Qualitätssicherung, Dokumentation und Versionierung.
  • Statistische Auswertung, Integration und Interpretation klinischer, mikrobiologischer und metagenomischer Datensätze in enger Zusammenarbeit mit ärztlichen, wissenschaftlichen und technischen Teams.
  • Anwendung innovativer Verfahren in der Forschung und in der klinischen Beratung von Patienten, Gesunden, Partnern aus dem Gesundheits- und Wissenschaftsbereich, Aktive Mitarbeit in Forschungsverbünden und Einwerbung von Drittmitteln und Publikation der Forschungsergebnisse

Ihr Profil

  • Abgeschlossenes Studium (Biowissenschaften, Medizin, Bioinformatik, Medizininformatik o. ä.) und ggf. Promotion
  • Kenntnisse einschlägiger Analyse- und Sequenziermethoden, Datenbanken und Statistikverfahren
  • Fundierte Kenntnisse und Erfahrungen im Themenfeld des humanen Mikrobioms und der Mikrobiom- und Metagenomanalytik
  • Darüber hinaus überzeugen Sie mit Ihrer selbstständigen, strukturierten, lösungsorientierten und verantwortungsbewussten Arbeitsweise sowie Ihrer Team- und Begeisterungsfähigkeit und Ihrem hohen Engagement und Flexibilität

Wir bieten Ihnen

  • Zielorientierte individuelle Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
  • Arbeiten mit modernsten Techniken / technischen Einrichtungen
  • Möglichkeit zum mobilen Arbeiten
  • Flexible Arbeitszeiten im Rahmen der Gleitzeit
  • Möglichkeit der Promotion / Habilitation
  • Möglichkeit, wissenschaftlich zu publizieren wird geboten und unterstützt
  • Interdisziplinäre Zusammenarbeit mit Forschungseinrichtungen in Heidelberg und Mannheim (Health & Life Science Alliance)
  • Bei Eignung (Teil-)Projektleitung / Projektverantwortung möglich
  • Möglichkeit der Teilnahme an nationalen und internationalen Tagungen
  • Tarifvertragliche Vergütung nach TV-L E13, attraktive betriebliche Altersvorsorge
  • 30 Tage Urlaub
  • Nachhaltig unterwegs: Jobticket (Deutschlandticket)
  • Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperationen zur Kinderbetreuung, Zuschuss zur Kinderferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
  • Vielfältige Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote

Kontakt & Bewerbung

Für weitere Informationen steht Ihnen gerne Prof. Dr. Ingo Autenrieth via E-Mail zur Verfügung. Interessiert?Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung direkt über unser Online-Bewerbungssystem .


Digitale und Molekulare Mikrobiologie
Prof. Dr. med. Ingo Autenrieth – Ärztlicher Direktor
Im Neuenheimer Feld 130.3
69120 Heidelberg
[email protected]

Hinweis: Das UKHD unterliegt den Bestimmungen des Infektionsschutzgesetzes. Daher ist für alle am UKHD beschäftigten Personen ein gültiger Masern-Immunitätsnachweis notwendig. Das UKHD lebt Vielfalt und schätzt die Diversität. Unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, Herkunft oder Religion bieten wir allen die gleichen Chancen. Wenn ein Geschlecht in einem bestimmten Bereich unterrepräsentiert ist, legen wir besonderen Wert darauf, diesem Ungleichgewicht entgegenzuwirken. Bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung geben wir Menschen mit Schwerbehinderung Vorrang bei der Berücksichtigung für offene Stellen.

Veröffentlicht am 2026-06-08

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